Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms