Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms