Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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