Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
A6NL46 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A6NL46 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A6NL46 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A6NL46 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A6NL46 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
A6NL46 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
A6NL46 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
A6NL46 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A6NL46 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
A6NL46 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
A6NL46 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A6NL46 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A6NL46 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
A6NL46 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A6NL46 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A6NL46 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
A6NL46 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
A6NL46 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NL46 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NL46 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NL46 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NL46 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NL46 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NL46 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NL46 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NL46 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NL46 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NL46 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NL46 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NL46 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NL46 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NL46 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NL46 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NL46 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NL46 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NL46 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NL46 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NL46 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NL46 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NL46 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NL46 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NL46 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NL46 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NL46 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NL46 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NL46 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A6NL46 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A6NL46 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A6NL46 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A6NL46 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A6NL46 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A6NL46 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms