Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1LA6NFU8 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms