Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms