Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms