Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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