Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CLEC4AQ9UMR7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CLEC4AQ9UMR7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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CLEC4AQ9UMR7 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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CLEC4AQ9UMR7 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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CLEC4AQ9UMR7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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CLEC4AQ9UMR7 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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CLEC4AQ9UMR7 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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CLEC4AQ9UMR7 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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