Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRPF3Q9ULD4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms