Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID6

ZNF639, Zinc finger protein 639, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF639Q9UID6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms