Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms