Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms