Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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VAPAQ9P0L0 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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VAPAQ9P0L0 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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VAPAQ9P0L0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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VAPAQ9P0L0 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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VAPAQ9P0L0 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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VAPAQ9P0L0 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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VAPAQ9P0L0 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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VAPAQ9P0L0 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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