Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ7

PCDHB16, Protocadherin beta-16, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB16Q9NRJ7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PCDHB16Q9NRJ7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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PCDHB16Q9NRJ7 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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