Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV7

PRDM9, Histone-lysine N-methyltransferase PRDM9, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM9Q9NQV7 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRDM9Q9NQV7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms