Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms