Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms