Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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