Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms