Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms