Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms