Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms