Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms