Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms