Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms