Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms