Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT23

LIMD2, LIM domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD2Q9BT23 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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