Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms