Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms