Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 YPEL2-202ENST00000581865 480 ntTSL 214.78□□□□□ -0.045e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 FBXL21-203ENST00000472159 768 ntTSL 214.71□□□□□ -0.055e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 ATG4B-213ENST00000460211 871 ntTSL 214.7□□□□□ -0.066e-11■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.065e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 GGA3-220ENST00000613421 5156 ntTSL 214.54□□□□□ -0.085e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.095e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.15e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.115e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 SEMA4C-203ENST00000449330 839 ntTSL 314.34□□□□□ -0.115e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.125e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 FAM193B-215ENST00000513282 651 ntTSL 314.26□□□□□ -0.135e-9■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.135e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.145e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 LMBR1L-221ENST00000551535 874 ntTSL 214.19□□□□□ -0.145e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 DLGAP4-214ENST00000491207 469 ntTSL 414.12□□□□□ -0.155e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.165e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 YPEL2-203ENST00000582192 3193 ntTSL 214.05□□□□□ -0.165e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 FAM193B-202ENST00000504130 394 ntTSL 513.78□□□□□ -0.25e-9■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.215e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 TGFBRAP1-203ENST00000595531 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.225e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 GGA3-215ENST00000582821 1018 ntTSL 213.67□□□□□ -0.225e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.225e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 VARS-225ENST00000482996 728 ntTSL 313.61□□□□□ -0.235e-9■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.245e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 SPATS2L-226ENST00000471601 1730 ntTSL 213.44□□□□□ -0.265e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 SEMA4C-206ENST00000482925 3776 ntTSL 213.42□□□□□ -0.265e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 ISM2-201ENST00000216481 3045 ntTSL 213.39□□□□□ -0.278e-7■■■■□ 23.5
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TBRG4Q969Z0 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.286e-11■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 FBXO16-210ENST00000521548 2983 ntTSL 213.29□□□□□ -0.285e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 TUBG1-204ENST00000589688 1505 ntTSL 513.22□□□□□ -0.295e-9■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 NBAS-206ENST00000433283 687 ntTSL 213.17□□□□□ -0.35e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 DENND4C-205ENST00000434457 6718 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.315e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.335e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 IGF2BP3-214ENST00000492771 564 ntTSL 412.99□□□□□ -0.335e-9■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 SRP54-AS1-202ENST00000555015 561 ntTSL 312.72□□□□□ -0.375e-7■■■■□ 23.5
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TBRG4Q969Z0 FAM102A-203ENST00000373095 4144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.395e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 DHRS12-202ENST00000280056 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.45e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 DLGAP4-209ENST00000479220 577 ntTSL 312.53□□□□□ -0.45e-6■■■■□ 23.5
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TBRG4Q969Z0 TXLNA-202ENST00000373610 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.435e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 YPEL2-201ENST00000312655 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.445e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 SPATS2L-208ENST00000409718 2648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.444e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 FAM102A-206ENST00000493175 423 ntTSL 312.32□□□□□ -0.445e-7■■■■□ 23.5
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TBRG4Q969Z0 NFATC3-217ENST00000566893 715 ntTSL 212.23□□□□□ -0.455e-6■■■■□ 23.5
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TBRG4Q969Z0 ISM2-202ENST00000342219 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.58e-7■■■■□ 23.5
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TBRG4Q969Z0 SYNE4-203ENST00000397428 382 ntTSL 311.53□□□□□ -0.565e-7■■■■□ 23.5
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TBRG4Q969Z0 CMTR1-201ENST00000373451 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.665e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 DLGAP4-215ENST00000495241 794 ntTSL 210.92□□□□□ -0.665e-6■■■■□ 23.5
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TBRG4Q969Z0 GGA3-201ENST00000537686 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.75e-7■■■■□ 23.5
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TBRG4Q969Z0 PUS7L-202ENST00000416848 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.785e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 ITGA2-203ENST00000509814 3487 ntTSL 1 (best)10.12□□□□□ -0.794e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 NFATC3-204ENST00000379165 3583 ntTSL 210.01□□□□□ -0.815e-6■■■■□ 23.5
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TBRG4Q969Z0 GGA3-210ENST00000580799 521 ntTSL 59.96□□□□□ -0.825e-7■■■■□ 23.5
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TBRG4Q969Z0 TUBG1-203ENST00000589613 916 ntTSL 1 (best)9.93□□□□□ -0.825e-9■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 IGF2BP3-202ENST00000421467 2988 ntTSL 59.87□□□□□ -0.835e-9■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 GGA3-223ENST00000621870 4034 ntTSL 1 (best)9.85□□□□□ -0.835e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 FKBP1A-202ENST00000381719 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.855e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 PHC3-209ENST00000484068 913 ntTSL 49.72□□□□□ -0.855e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 TJP2-203ENST00000377259 588 ntTSL 39.7□□□□□ -0.865e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 ITGA2-206ENST00000513685 3501 ntTSL 1 (best)9.67□□□□□ -0.864e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 NFATC3-208ENST00000553077 3870 ntTSL 29.56□□□□□ -0.885e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 ITGA2-205ENST00000510722 3530 ntTSL 1 (best)9.49□□□□□ -0.894e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 LPCAT1-205ENST00000513757 547 ntTSL 49.45□□□□□ -0.95e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 ITGA2-204ENST00000509960 3674 ntTSL 1 (best)9.44□□□□□ -0.94e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 GGA3-222ENST00000621217 4181 ntTSL 29.14□□□□□ -0.955e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 UBE2N-205ENST00000550657 3018 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.955e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 HIPK2-201ENST00000342645 2937 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.967e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 SORCS2-204ENST00000511199 532 ntTSL 48.85□□□□□ -0.995e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 SPATS2L-227ENST00000619961 6115 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.994e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 GGA3-202ENST00000538886 3766 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -15e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 AC013394.1-202ENST00000630790 4499 ntTSL 28.83□□□□□ -15e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 APOB-201ENST00000233242 14121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -15e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 LMBR1L-222ENST00000551782 567 ntTSL 48.74□□□□□ -1.015e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 SPATS2L-201ENST00000358677 6156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.014e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 ITGA2-202ENST00000503810 3782 ntTSL 58.72□□□□□ -1.014e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 PCID2-213ENST00000484641 800 ntTSL 58.63□□□□□ -1.035e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 AC009053.1-202ENST00000563377 2051 ntBASIC8.58□□□□□ -1.045e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 CHD2-206ENST00000625990 888 ntTSL 58.51□□□□□ -1.055e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 SENP2-205ENST00000444509 610 ntTSL 58.25□□□□□ -1.095e-7■■■■□ 23.5
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