Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms