Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEO1Q92859 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms