Protein–RNA interactions for Protein: Q92759

GTF2H4, General transcription factor IIH subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H4Q92759 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H4Q92759 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms