Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms