Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC84Q86UT8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC84Q86UT8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC84Q86UT8 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC84Q86UT8 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC84Q86UT8 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC84Q86UT8 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC84Q86UT8 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC84Q86UT8 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC84Q86UT8 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC84Q86UT8 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC84Q86UT8 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC84Q86UT8 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC84Q86UT8 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC84Q86UT8 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC84Q86UT8 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC84Q86UT8 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC84Q86UT8 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC84Q86UT8 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC84Q86UT8 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC84Q86UT8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC84Q86UT8 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC84Q86UT8 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC84Q86UT8 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC84Q86UT8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC84Q86UT8 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC84Q86UT8 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC84Q86UT8 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms