Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms