Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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