Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms