Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms