Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDE2Q6IQ49 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms