Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HES3Q5TGS1 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms