Protein–RNA interactions for Protein: Q5JPI3

C3orf38, Uncharacterized protein C3orf38, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf38Q5JPI3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C3orf38Q5JPI3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms