Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAVIN4Q5BKX8 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms