Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms