Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PKDCCQ504Y2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKDCCQ504Y2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKDCCQ504Y2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms