Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms