Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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PTPRNQ16849 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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PTPRNQ16849 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
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PTPRNQ16849 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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PTPRNQ16849 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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PTPRNQ16849 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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PTPRNQ16849 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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PTPRNQ16849 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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PTPRNQ16849 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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PTPRNQ16849 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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PTPRNQ16849 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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