Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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PTPROQ16827 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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PTPROQ16827 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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PTPROQ16827 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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PTPROQ16827 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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PTPROQ16827 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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