Protein–RNA interactions for Protein: Q16663

CCL15, C-C motif chemokine 15, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL15Q16663 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL15Q16663 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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